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基于双心医学理论和分子对接...芩药对治疗冠心病的作用机制_刘鑫.pdf

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资源描述

1、184第25 卷 第 2 期 2023 年 2 月辽 宁 中 医 药 大 学 学 报JOURNAL OF LIAONING UNIVERSITY OF TCMVol.25 No.2 Feb.,2023基于双心医学理论和分子对接技术探讨柴胡-黄芩药对治疗冠心病的作用机制刘鑫,于嘉祥,曲超,于游,张欢,于睿(辽宁中医药大学,辽宁 沈阳 110847)基金项目:中医药古籍文献和特色技术传承专项(GZY-KJS-2020-026);辽宁省博士启动基金项目(2021-BS-1762020)作者简介:刘鑫(1988-),女,辽宁抚顺人,讲师,在站博士后,研究方向:中西医结合治疗心血管疾病。通讯作者:于睿(

2、1969-),女,辽宁阜新人,主任医师,博士研究生导师,博士,研究方向:中西医结合治疗心血管疾病。E-mail:。摘要:目的 从双心理论角度出发,应用网络药理学的研究方法及分子对接技术,探讨柴胡-黄芩药对对冠心病的疗效机制。方法 应用中药系统药理学数据库与分析平台将柴胡、黄芩两味中药的有效成分及作用靶点进行查询及筛选,再利用TCMID、TCM-MESH、BATMAN-TCM、SymMap数据库对结果进行补充。从GeneCards数据库检索冠心病的疾病靶点,利用Venney 2.1.0在线程序绘制柴胡-黄芩-冠心病交集靶点韦恩图,再用Cytoscape软件进行可视化处理。用enrichGO、en

3、richKEGG函数分别进行GO注释和KEGG通路富集分析,AutoDock vina将柴胡-黄芩的有效成分与重要蛋白受体进行分子对接。结果 筛选出柴胡-黄芩药对治疗冠心病作用的共同靶点112个,GO注释生物过程1776条,细胞组成63条、分子功能132条。KEGG富集分析显示柴胡-黄芩药对主要通过PTGS1、PTGS2、PPARG、NOS、NCOA2、GSK3B、ADRB1、ADRA2A、HTR2A等靶点及流体剪应力与动脉粥样硬化、IL-17、雌激素、松弛素、HIF-1、TNF等信号通路发挥作用。分子对接结果显示柴胡-黄芩有效化合物配体小分子与受体蛋白对接结果均-5.0 kcal/moL,并

4、通过氢键作用、疏水作用、Pi-Pi共轭作用维持稳定构象。结论 文章揭示了柴胡-黄芩药对治疗冠心病的潜在机制,进一步印证了中药多途径、多靶点的治疗特点,为临床基于“双心医学”论治冠心病提供理论依据。关键词:柴胡;黄芩;冠心病;双心医学;分子对接中图分类号:R285.5 文献标志码:A 文章编号:1673-842X (2023)02-0184-08Research on the Mechanism of Chaihu(Bupleuri Radix)-Huangqin(Scutellariae Radix)Drug Pair in Treating Coronary Heart Disease Ba

5、sed on Double Heart Medicine and Molecular DockingLIU Xin,YU Jiaxiang,QU Chao,YU You,ZHANG Huan,YU Rui(Liaoning University of Traditional Chinese Medicine,Shenyang 110847,Liaoning,China)Abstract:Objective To explore the potential therapeutic effects of Chaihu(Bupleuri Radix)-Huangqin(Scutellariae Ra

6、dix)drug pair on coronary heart disease from the perspective of double-heart medicine theory by using network pharmacology research methods and molecular docking technology.Methods Through the TCMSP query and screen Chaihu(Bupleuri Radix)and Huangqin(Scutellariae Radix),and through TCMID,TCM-MESH,BA

7、TMAN-TCM and SymMap databases supplement the results of TCMSP.The disease targets of coronary heart disease were retrieved from the GeneCards database,and the Venn diagram of Chaihu(Bupleuri Radix)-Huangqin(Scutellariae Radix)-coronary heart disease intersection targets was drawn using the online pr

8、ogram of Venney 2.1.0,and then visualized by Cytoscape software.Using enrichGO and enrichKEGG functions to perform GO annotation and KEGG pathway enrichment analysis,respectively,AutoDock vina to molecularly dock the active ingredients of Chaihu(Bupleuri Radix)-Huangqin(Scutellariae Radix)and import

9、ant protein receptors.Results We screened out 112 common targets of Chaihu(Bupleuri Radix)-Huangqin(Scutellariae Radix)baicalensis for the treatment of coronary heart disease,1776 GO-annotated biological processes,63 cell composition,132 molecular functions,mainly related to cell response to drugs,r

10、esponse to nutritional levels.The reaction to oxidative stress,the metabolic process of reactive oxygen species,and the response to steroid hormones.KEGG enrichment analysis showed that Chaihu(Bupleuri Radix)-Huangqin(Scutellariae Radix)baicalensis drug pair mainly through PTGS1,PTGS2,PPARG,NOS,NCOA

11、2,GSK3B,ADRB1,ADRA2A,HTR2A and other targets and fluid shear stress and atherosclerosis,IL-17,estrogen,signal pathways such as relaxin,HIF-1 and TNF play a role.The molecular docking results showed that the docking results of the small molecules of the effective compound ligand of Chaihu(Bupleuri Ra

12、dix)-Huangqin(Scutellariae Radix)and the receptor protein were less than-5.0 kcal/mol,and the stable conformation was maintained through hydrogen bonding,hydrophobic interaction,and Pi-Pi conjugation.Conclusion This article reveals the potential mechanism of Chaihu(Bupleuri Radix)-Huangqin(Scutellar

13、iae Radix)baicalensis for the treatment of coronary heart disease,further confirms the multi-channel and multi-target treatment characteristics of traditional Chinese medicine,and provides a theoretical basis for the clinical treatment of coronary heart disease based on“double heart medicine”.Keywor

14、ds:Chaihu(Bupleuri Radix);Huangqin(Scutellariae Radix);coronary atherosclerotic heart disease;double heart medicine;molecular dockingDOI:10.13194/j.issn.1673-842x.2023.02.036185 25 卷 辽宁中医药大学学报 现代人的工作压力越来越大,不良生活方式及饮食习惯等问题暴露越来越多,由此引发的精神心理及身心健康问题也逐渐增加,欧洲心脏病学会(European Society of Cardiology,ESC)在2019年 初

15、也发布了 抑郁和冠心病的意见书。流行病学调查发现,冠心病与抑郁、焦虑等精神心理问题具有双向关联性,冠心病患者中抑郁是非常常见的,抑郁很可能是决定冠心病预后情况是否良好的独立危险因素1-2。中医学中虽然没有冠心病这一名词,但其与“胸痹”“心痛”等病相类似,可归属于此类疾病。抑郁、焦虑等在中医学中是情志不畅的表现,情志不畅也是胸痹等多种疾病的主要发病原因。自胡大一教授提出“双心医学”模式后3,越来越多的医者开始探索从“心脏-心理”双角度对患者展开治疗。柴胡-黄芩这一药物组合最早源于 伤寒论中的小柴胡汤,并且是柴胡类方剂的重要组成药物,此类方剂在临床上应用广泛4,对冠心病5、抑郁6、新冠肺炎、咳嗽7

16、-8、糖尿病9、功能性消化不良10等多种疾病均有较好的治疗效果。本文借助网络药理学方法和分子对接技术深入挖掘柴胡-黄芩药对对冠心病的“中药-成分-靶点-疾病”关系,分析可能的作用机制,力求为临床基于“双心医学”论治冠心病提供依据。1研究方法1.1 柴胡-黄芩药对有效成分及作用靶点的筛选应用TCMSP平台,分别以“柴胡”和“黄芩”为关键词,查找两味药的化学有效成分。为了获得药物有效成分,生物利用度(OB)和类药性(DL)这两个筛选条件分别设置为 30%和 0.18。根据TCMID、TCM-MESH、BATMAN-TCM、SymMap等数据库及相关文献检索结果,对之前获得的柴胡和黄芩的有效成分进行补充。柴胡-黄芩对冠心病治疗作用的可能靶点通过TCMSP靶点预测模型进行判断。检索PubChem数据库,对符合筛选标准的有效成分的分子结构式进行确认,选取可检索到并可以下载为sdf2D结构的分子结构式下载并保存为sdf格式,用Chem3D打开并保存为pdb格式,再次用Auto Dock打开,进行相关处理后保存为pdbqt格式,以备后续对接使用。1.2 柴胡-黄芩药对治疗冠心病的潜在靶点的收集检 索

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