1、病 毒 学 报CHINESE JOURNAL OF VIROLOGYVol.39No.3May 2023第 39 卷 第 3 期 2 0 2 3 年 5 月人星状病毒研究进展李函凝1,傅佳美2,高志勇3*(1.首都医科大学 公共卫生学院,北京 100069;2.中国医科大学 公共卫生学院,沈阳 110122;3.北京市疾病预防控制中心 传染病地方病控制所,北京 100013)摘要:人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)属于星状病毒科,包含多种基因型,是引起急性胃肠炎散发病例的重要病原之一,偶尔也可在人员密集场所引起疫情的暴发。除消化系统以外,HAstV 还可以在其他系统中被
2、检出,其中中枢神经系统相关的研究最为广泛。目前 HAstV 的检测方法较前有所完善,已有多种分子检测技术和细胞模型被用于 HAstV 的研究和检测。本文就 HAstV 的病原学特征、常用检测方法、所致疾病、流行病学特征以及防控措施进行综述。关键词:星状病毒;胃肠炎;病原学;流行病学中图分类号:R373.2 R512.5 文献标识码:A 文章编号:10008721(2023)03083908DOI:10.13242/ki.bingduxuebao.004338人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)属于星 状 病 毒 科(Astroviridae)哺 乳 动 物 星 状 病 毒
3、 属(Mamastrovirus),是 在 1975 年 由 Appleton 和Higgins1使用电镜观察腹泻儿童粪便标本时首次发现。电镜下,约 10%的 HAstV 病毒颗粒表面带有 5个或 6 个星尖状的突起,状似星形,因此得名2。本文从 HAstV 的病原学一般特征、常用检测方法、所致疾病、流行病学特征、防控措施等方面进行综述。1 病原体一般特征1.1 基因组结构HAstV 是一种无包膜的单股正链 RNA 病毒,基因组长度约为 7 kb,包含 3 个开放阅读框分别为ORF1a、ORF1b 和 ORF23,4。ORF1a 和 ORF1b 主要编码与病毒基因组的转录和复制相关的非结构蛋白
4、5。ORF2则主要编码结构蛋白,其编码蛋白质的羧基端是相对变异性较高的区域,可被用于划分HAstV 的基因型3。ORFX 是近年来新发现的存在于几乎所有 HAstV 中的开放阅读框,在+1 阅读框内 与 ORF2 序 列 的 5末 端 重 叠,长 约 112 个 核 苷酸6。ORFX 编 码 的 蛋 白 质 被 命 名 为 X 蛋 白(X protein)7。X 蛋白在病毒复制的后期起到关键作用,其在定位、影响细胞渗透性和药物抑制等方面中与冠状病毒 E 蛋白、HIV 1 型病毒 Vpu 蛋白和甲型流感病毒 M2蛋白等研究广泛的病毒膜孔蛋白有相似之处7。对 X 蛋白进行深入研究,可为 HAstV
5、 疫苗的开发和相关疾病的治疗提供新的思路7。1.2 分型HAstV 目 前 主 要 包 括 经 典 型 HAstV 和 新 型HAstV。经典型 HAstV 划分为 8 种基因型,分别对应 8 种血清型,依次被命名为 HAstV1HAstV8。根据 ORF2 的同源性,每种基因型又分为了不同的亚型:HAstV1(HAstV1af)、HAstV2(HAstV2ad)、HAstV3(HAstV3ac)、HAstV4(HAstV4ac)、HAstV5(HAstV5ac)、HAstV6(HAstV6ab)8。目前新型 HAstV 包括人星状病毒墨尔本株(HAstVMLB)和人星状病毒弗吉尼亚株/人貂绵
6、羊样株(HAstVVA/HMO)两个分支。HAstVMLB 包含3种基因型,被命名为 HAstVMLB1HAstVMLB3(MLB1MLB3);HAstVVA/HMO 分为 5 种基因型,分别为 HAstVVA1/HMOC(VA1)、HAstVVA2/HMO A(VA2)、HAstV VA3/HMO B(VA3),HAstVVA4(VA4)和 HAstVVA5/BF34(VA5)9,10。是否存在其他 HAstV 的型别或亚型,有待进一步的研究。2 常用检测方法电子显微镜镜检因设备昂贵、使用相对繁琐、检测灵敏度低等原因已较少使用。ELISA 等酶免检测试剂可供选择不多、灵敏度欠佳。实时荧光定量
7、逆转录聚合酶链式反应由于灵敏度高、实时性好、自动化程度高、无污染性等特点成为检测 HAstV 常用的方法。有多组特异性的引物和探针可供选择,较收稿日期:20220722;接受日期:20230501基金项目:首都卫生发展科研专项(项目号:202021011),题目:北京市诺如病毒急性胃肠炎疫情发生规律、病毒基因变异和防控策略研究作者简介:李函凝(2000),女,主要从事预防医学,Email:L通讯作者:高志勇(1977),男,研究员,主要从事肠道传染病流行病学和病原学研究,Email:开放科学(OSID)病 毒 学 报39卷常 用 的 是:上 游 引 物(ASTVs):5 TCTYATAGACC
8、GYATTATTGG3;下 游 引 物(ASTVas):5TCAAATTCTACATCATCACCAA3;探针(ASTVTQFAM):5FAMCCCCADCCATCATCATCTTCATCA BHQ1 311。RTPCR 常用于部分基因片段扩增,可进行测序分型,常用引物见表 112。近年来,高通量测序技术(HTS)的出现推动了 HAstV 研究的进一步发展。一方面该技术可帮助加深对 HAstV 部分或全部基因组序列的认识,为病毒多样性、HAstV 发病机制等方面的研究提供有价值的信息,另一方面该技术被应用于不明病因疾病的鉴别诊断,为亲神经系统 HAstV 的发现提供了途径,在新型 HAstV
9、的发现方面起到重要作用13。细胞分离培养是检测的金标准,但由于目前缺乏对所有 HAstV 在机体内生长繁殖过程的认识,因此尚无通用的细胞模型14。人结肠癌细胞系(Caco2)是培养经典型 HAstV 最常用的细胞系15。在新型 HAstV 中,MLB1和 MLB2 可用肺腺癌人类肺泡基底上皮细胞系(A549)和人肝癌细胞(Huh7)培养,HAstVVA1 可用 Caco2、A549、人源胚肾细胞(HEK293T)和原代星形胶质细胞培养14。此外,近年来已成功构建出一种人类肠道上皮细胞培养系统(HIE)可用于培养 HAstV1、VA1和 MLB1,是少有的可同时适用于经典型和新型 HAstV 的
10、细胞模型,有助于 HAstV的进一步研究15。3 所致疾病3.1 胃肠道疾病HAstV 引起的病毒性胃肠炎通常呈自限性,潜伏期 一 般 是 1 d5 d,中 位 数 为 4.5 d(95%CI:3.9 d5.2 d)16。临床表现主要是水样腹泻,可伴随呕吐、腹痛、发热、厌食等症状,偶见脱水等严重的并发症,整个病程一般持续 2 d3 d5,17。HAstV 感染者的排毒时间较长,症状完全消失 2 周以后的感染者粪便中仍可检出 HAstV18。对于存在免疫缺陷的感染者,病毒排毒时间更长,部分患者可超过 3个月19。此外,HAstV 隐性感染的发生率也较高。在美国纳什维尔市无胃肠炎和免疫缺陷的未成年
11、人中HAstV 的感染者可占 2%20。在韩国的一起 HAstV疫 情 中 无 症 状 感 染 者 占 全 部 感 染 者 的 50%21。Gabriela等22研究发现 HAstV 无症状感染者粪便中的病毒载量高于患者8。不同基因型 HAstV 对胃肠道的影响具有差异。经典型 HAstV 与胃肠炎的发生密切相关。感染HAstV3 的病例患持续性胃肠炎的比例较高,且其排毒量高于感染 HAstV1、HAstV2、HAstV4 和 HAstV-3b DQ630763 HAstV-3a GU732187 HAstV-3c KF668570 HAstV-7 AF248738 HAstV-7 Y0863
12、2 HAstV-1b FJ375759 HAstV-1a HQ398856 HAstV-1d AY720892 HAstV-6b HM237363 HAstV-6a GQ495608 HAstV-5c JQ403108 HAstV-5a DQ028633 HAstV-5b AB000298 HAstV-8 AF260508 HAstV8 Z66541 HAstV-4c KF039913 HAstV-4b DQ070852 HAstV-4a AY720891 HAstV-2a AB000289 HAstV-2d JX087964 HAstV-2b AB000288 HAstV-2c KF0399
13、11 MLB1 FJ222451 MLB3 JX857870 MLB2 JF742759 VA1 FJ973620 VA3 JX857868 VA5 KJ656124 VA2 GQ502193 VA4 JX8578691001001001009784100821001001001009210097100100981001001009788100图 1HAstVs ORF2全长基因序列系统发生树注:使用 MEGA 11.0.6软件,采取邻接法构建系统发生树,bootstrap检验(1 000次)评估树的可靠性Figure 1Phylogenetic tree of the complete OR
14、F2 genes of HAstVsNotes:Phylogenetic tree was constructed using a neighborjoining method with 1,000 bootstrap replicates by MEGA 11.0.6 software 8403期李函凝,等.人星状病毒研究进展HAstV8 等 其 他 经 典 型 HAstV 的 患 者22。新 型HAstV是否可以引起胃肠道症状仍不确定23。3.2 肠外疾病除胃肠炎患者以外,患有其他疾病的人群体内也可能发现 HAstV。HAstV 可在患有脑炎、脑膜炎等疾病患者的中枢神经系统中被检出,多数患
15、者的免疫功能低下24。HAstV4、MLB1、MLB2 和 VA1可在免疫功能低下的感染者中枢神经系统中被检出,其中报告检出 VA1 的病例最多24,25。此外,免疫功能正常人群的中枢神经系统中也可能发现HAstV,相关报道较免疫功能低下者少。Georgia等26在一名非免疫缺陷的脑炎患者的脑脊液中检测出了 HAstV1。Samuel 等27在一名免疫力正常的急性脑膜炎患者脑脊液中检出了 MLB2。此外,HAstV 也可以在呼吸道疾病、肝炎疾病患者的体内被检出。在上呼吸道感染儿童的鼻咽拭子中可检出 MLB1 和 MLB2,目前的证据支持它们可以在上呼吸道进行复制的结论28。多数不明原因肝炎患者
16、的血清中能检测到 VA329。HAstV 是否可以导致肠外组织的病变需要进一步的研究。3.3 混合感染HAstV 与其他病原体混合感染的情况较为普遍。20102015年德国 2 877名急性胃肠炎患者中检出星状病毒感染 143 例,其中混合感染者占 71.3%(102/143)30。由于易感季节、传播方式和流行强度等原因,HAstV 主要与其他胃肠道病毒发生混合感染,以合并感染 A 组轮状病毒或诺如病毒的情况最为普遍31,其次是与细菌的合并感染以致泻性大肠埃希菌为最常见的类型31,寄生虫则相对少见。偶有 HAstV 与寄生虫或细菌混合感染率高于与病毒混合感染率的报道32,这可能与当地主要流行的病原体相关。HAstV 混合感染引起的临床症状较单独感染严重,病程更长,为疾病的病原确认和治疗带来一定困难。经典型 HAstV 在混合感染患者粪便中的病毒载量低于单一感染,而在新型 HAstV 中可能由于样本量限制等原因并没有发现这一特点33。目前,HAstV 与其他病原体在混合感染中的相互作用尚不明确,但有动物实验表明 HAstV 可能在混合感染中发挥保护机体的作用。Harshad 等34研究发