1、分子诊断与治疗杂志2023年1月第15卷第1期J Mol Diagn Ther,January 2023,Vol.15No.1论著作者单位:1.广东省人民医院珠海医院(珠海市金湾中心医院)检验科,广东,珠海 5190412.广东省人民医院珠海医院(珠海市金湾中心医院)儿科,广东,珠海 5190413.广州达安临床检验中心,广东,广州 510670通信作者:黄小燕,Email:儿童社区获得性肺炎病例病原谱分析黄小燕1东建亭2曾宪鍫3摘要 目的分析珠海市金湾区 2018 至 2019 年儿童社区获得性肺炎病例的病原体谱结果,总结病原流行病学特征,为新发病例的诊治提供依据。方法回顾性分析 2018
2、年 12 月至 2019 年 11 月在珠海市金湾区住院,符合儿童社区获得性肺炎诊断的 805 例患儿咽拭子标本,通过多重 PCR 和Luminex 液相芯片杂交进行 13 种呼吸道病原体的核酸检测,对结果按照患儿年龄进行分组统计分析,各分组年龄区间为 06 月龄、612 月龄、13 周岁、37 周岁、7 周岁以上。结果580 例患儿咽拭子的病原体核酸检测为阳性;235 例患儿检出两或以上病原体核酸阳性;检出率最高的前 3 种病原体分别是肺炎链球菌(SP)、呼吸道合胞病毒(RSV)和肺炎支原体(MP)。RSV 在 1 岁以下低龄患儿中常见;ADV 和MP 在 1 岁以上患儿中检出率更高;其他病
3、原体在各年龄组段分布比较平均。大多数季节特异的病原体如 SP、HRV、MC、ADV、RSV 检出高峰在春季(13 月份)和冬季(1012 月),但也有少部分如 Hi 和 MP 有独立的流行规律,在非检出高峰时段流行。结论在临床诊断和治疗中,应注意病原体流行的季节性变化、不同年龄组常见病原体的差异以及多种病原体的感染。关键词 多重PCR;液相芯片杂交技术;儿童社区获得性肺炎;病原体;儿童Pathogen spectrum surveillance of children with community acquired pneumoniaHUANG Xiaoyan1,DONG Jianting2,
4、ZENG Xianqiao3(1.Department of Laboratory Medicine,Department of Guangdong Provincial Peoples Hospital Zhuhai Hospital(Zhuhai Jinwan Central Hospital),Zhuhai,Guangdong,China,519041;2.Department of Pediatrics,Guangdong Provincial Peoples Hospital Zhuhai Hospital(Zhuhai Jinwan Central Hospital),Zhuhai
5、,Guangdong,China,519041;3.Guangzhou Daan Clinical Laboratory Center,Yunkang Group,Guangzhou,Guangdong,China,510670)ABSTRACT ObjectiveTo analyze the pathogen spectrum results of communityacquired pneumonia cases among children in Jinwan District,Zhuhai City from 2018 to 2019,and summarize the epidemi
6、ological characteristics of the pathogens,to provide a basis for the diagnosis and treatment of new cases.MethodsThroat swabs of 805 children hospitalized in Guangdong Provincial Peoples Hospital Zhuhai Hospital(ZhuhaiJinwan Central Hospital)from December 2018 to November 2019 were collected,all of
7、whom were diagnosedcommunity acquired pneumonia according to their clinical symptoms.The nucleic acid of 13 respiratory tractpathogens was detected by multiplex PCR and liquid chip technology.The results were analyzed statistically according to the age groups of 06 months,612 months,13 years,37 year
8、s and 7 years.Results580throat swabs were detected positive,while 235 were detected two or more pathogenspositive.Among the 13pathogens,the 3 most common pathogenic etiologies were streptococcus pneumoniae(SP)respiratory syncytial virus(RSV)and mycoplasma pneumonia(MP).RSV was popular in children yo
9、unger than 1 years oldwhile ADV and MP were detected more frequently in children elder than 1 year.And the other 10 pathogensare more evenly distributed across all age groups.Detection peaks of most seasonspecific pathogen such asSP,HRV,MC,ADV,and RSV are at spring(JanuaryMarch)and winter(OctoberDec
10、ember),but Hi and 14DOI:10.19930/ki.jmdt.2023.01.019分子诊断与治疗杂志2023年1月第15卷第1期J Mol Diagn Ther,January 2023,Vol.15No.1MP have independent epidemiological pattern,which are prevalent during nondetection peak hours.ConclusionIn clinical diagnosis and treatment,attention should be paid to the seasonal var
11、iation of pathogen prevalence,the difference of common pathogens among age groups and the infection of multiple pathogens.KEY WORDSMultiplex PCR;Liquid chip technology;Community acquired pneumonia;Pathogens;Children儿童社区获得性肺炎(Community AcquiredPneumonia,CAP)是我国 5 岁以下儿童的主要致死疾病,该病大部分缺乏特征性的临床症状,需要借助病原学方
12、法才能确诊;但传统的病原体分离培养和免疫学方法存在很多缺陷,难以及时准确地发现病原体12。本研究回顾性分析了 805 例于 2018 年 12 月到 2019 年 11 月在广东省人民医院珠海医院(珠海市金湾中心医院)就诊,符合儿童社区获得性肺炎诊断且其呼吸道标本采用多重 PCR 和 Luminex 液相芯片杂交技术进行了 13 种常见呼吸道病原体核酸检测的患儿的数据。通过对不同季节和年龄组的病原体谱分析,总结流行病规律,希望借此帮助临床医生形成更准确的临床诊断,使患儿获得更好的治疗。1资料与方法1.1一般资料回顾性分析 2018 年 12 月至 2019 年 11 月在广东省人民医院珠海医院
13、(珠海市金湾中心医院)就诊,符合儿童 CAP 诊断并进行了 13 种常见呼吸道病原体核酸检测的 805 例患儿的资料。其中,男性 475 例,女性 330 例;06 月龄患儿 85 例(10.56%),612 月龄患儿 162 例(20.12%),13 周岁 患 儿 267 例(33.17%),37 周 岁 患 儿 226 例(28.07%),7 周岁以上患儿 65 例(8.07%),中位数年龄为 2 岁。诊断标准依据 儿童社区获得性肺炎诊疗规范(2019 年版)和 儿童社区获得性肺炎管理指南(2013 修订)2。1.2方法1.2.1标本采集患儿咽拭子置于样品保存管中,冷藏(28)保存,并在2
14、小时内冷藏运输实验室进行检测。1.2.2实验室检测由广州达安临床检验中心实验室完成,试剂盒覆盖的病原体包括 7 种 DNA 病原:AdV、hBoV、MP、Hi、BP、MC、SP 和 6 种 RNA 病毒:RSV、hMPV、FluA、FluB、PIV 和 HRV。采用启动液相芯片检测仪(美国 Luminex 公司,型号:MagPix50)检测。1.3数据分析采用 SPSS 22.0 软件进行数据分析,计量资料以(x s)表示,两两比较采用 t 检验,计数资料以n(%)表示,采用2检验,采用 Fisher 确切概率法检验,对各年龄组的儿童住院肺炎病例的病原谱进行分析和比较。以P7 周岁组检出率最高
15、的是 MP,阳性患儿占比 29.23%;它与 SP 的感染特点接近,即随着年龄增加检出率上升。另外要特别注意的是,Adv 在大于 3 岁的两个年龄组(37 周岁组和7 周岁组)检出率均超过10%,而在低龄组的检出率较低,感染规律与MP类似。13 种呼吸道病原体在各年龄组中的检出率见表2。项目BPHRVhBoVSPMPPIVRSVMCFluAFluBHihMPVAdV06 月(n=85)2(2.35)4(4.71)0(0.00)10(11.76)7(8.24)8(9.41)26(30.59)8(9.41)1(1.18)0(0.00)14(16.47)4(4.71)1(1.18)612 月(n=1
16、62)0(0.00)14(8.64)5(3.09)46(28.40)6(3.70)16(9.88)36(22.22)22(13.58)5(3.09)1(0.62)16(9.88)8(4.94)1(0.62)13 周岁(n=267)0(0.00)22(8.24)4(1.50)100(37.45)29(10.86)16(5.99)47(17.60)31(11.61)12(4.49)4(1.50)29(10.86)5(1.87)15(5.62)37 周岁(n=226)2(0.88)13(5.75)1(0.44)71(31.42)40(17.70)8(3.54)8(3.54)19(8.41)10(4.42)9(3.98)17(7.52)6(2.65)34(15.04)7 周岁(n=65)0(0.00)2(3.08)0(0.00)15(23.08)19(29.23)0(0.00)1(1.54)0(0.00)3(4.62)4(6.15)4(6.15)0(0.00)10(15.38)合计4(0.50)55(6.83)10(1.24)242(30.06)101(12.55)48(5.96)118(14