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海南省汉、黎族人群缺失型α-地中海贫血的研究.doc

1、关键词:地中海贫血;聚合酶链反应(PCR);少数民族;海南省 摘要:目的研究海南省汉、黎族人群中东南亚型缺失(-SEA)、右侧缺失(-3.7)和左侧缺失(-4.2)三种-地中海贫血缺失突变的携带率、基因频率及基因型的分布特点。方法应用聚合酶链反应(PCR)技术直接筛查海南省汉、黎族人群中的东南亚型缺失(-SEA)、右侧缺失(-3.7)和左侧缺失(-4.2)三种-地中海贫血缺失突变。结果在197例海南汉族人中检出25例-地中海贫血携带者,携带率为12.69%;三种-地中海贫血缺失突变的基因频率为0.0635,其中-SEA、-3.7和-4.2的基因频率分别为0.0127、0.0305、0.0203

2、,共发现-SEA/、-3.7/和-4.2/三种基因型,其中-SEA/5例,-3.7/12例,-4.2/8例。在201例海南黎族人中检出114例-地中海贫血携带者,携带率为56.72%,三种-地中海贫血缺失突变的基因频率为0.3607,其中-SEA、-3.7和-4.2的基因频率分别为0.3607、0.0075、0.1891,共发现-SEA/、-3.7/、-3.7/-3.7、-3.7/-4.2、-4.2/、和-4.2/-4.2六种基因型,其中-SEA/3例,-3.7/39例,-3.7/-3.76例,-3.7/-4.218例,-4.2/38例,-4.2/-4.210例。结论海南省汉、黎族人群是-地中

3、海贫血的高发群体。 关键词:地中海贫血;聚合酶链反应(PCR);少数民族;海南省 Investigationintothedeletiontypesof-thalassemiainHanandLINationalitiesinHainanProvince. Abstract:ObjectiveToinvestigatetheincidences、theallelicfrequenciesandthegenotypesfrequenciesofthree-tha-lassemiadeletiontypes(-SEA、-3.7、-4.2)andtheirdistributionsinHanandL

4、inationalitiesinHainanProvince.MethodsThree-thalassemiadeletiontypes,i.eSoutheastAsiadeletion(-SEA),rightdeletion(-3.7)andleftdeletion(-4.2),werescreenedbasedonpolymerasechainreaction(PCR)inHanandLinationalitiesinHainan.Results25carriersweredetectedin197Hanindividuals,andtheincidenceofcarrierswas12.

5、69%.Thegenefrequencyofthesethreedeletiontypeswas0.0127,0.0305and0.0203respectively,totally0.0635inHannationalityinHainan.Threegenotypesof5(-SEA/)cases,12(-3.7/)casesand8(-4.2/)casesweredetected.Onthecontrary,114carriersweredetectedfrom201individualsinLinationality,andtheincidenceofcarrierswas56.72%.

6、Thegenefrequencyofthesethreedeletiontypeswas0.0075,01716and0.1891respec-tively,totally0.3607inLinationality.Sixgenotypesweredetectedincluding3(-SEA/)cases,39(-3.7/)cases,6(-3.7/-3.7)cases,18(-3.7/-4.2)cases,38(-4.2/)casesand10(-4.2/-4.2)cases.ConclusionThereisahighincidenceof-thalassemiainHanandLina

7、tionalitiesinHainanprovince. !-empirenews.page- Keywords:Thalassemia;Polymerasechainreaction(PCR);Minoritynationality;HainanProvince -地中海贫血(-地贫)是一种严重危害人类健康的遗传病,其主要特征是-珠蛋白链合成减少(+地贫)或缺如(0地贫)。-地贫分子缺陷有基因的大片段缺失和非缺失突变两大类1,-珠蛋白基因缺失是导致-地贫的主要原因。目前全世界已发现了35种-珠蛋白基因缺失突变,在中国人中已发现7种,其中东南亚型缺失突变(-SEA)、右侧缺失型突变(-3.7)

8、和左侧缺失型突变(-4.2)三种突变类型是我国南方最常见的缺失类型24。为了研究海南省汉、黎族人群中-地中海贫血的发病率及其基因型的分布特点,我们应用聚合酶链反应(PCR)技术直接筛查197例海南汉族人和201例海南黎族人中的东南亚型缺失、右侧缺失和左侧缺失这三种最常见的缺失型-地贫突变类型,现将结果报告如下。 1材料与方法 1.1DNA样品用EDTA抗凝,采取海南省白沙、昌江、陵水、琼中、保亭等县正常体检、兵检和中小学生黎族人末梢血;采取海南省文昌市正常体检、兵检的海南籍汉族人群末梢血,按Lahiri等方法5提取DNA,阳性对照标本由南方医科大学医学遗传学教研室徐湘民教授惠赠。 1.2PCR

9、扩增东南亚型缺失突变分析按文献6进行;右侧缺失型突变和左侧缺失型突变分析参照AmoldS.-C.Tan7等报道合成引物。扩增-SEA、-3.7和-4.2的多重PCR体系均采用TaKaRaLATaqTMJ及缓冲液(宝生物工程有限公司产品),PCR反应体积为25l,在PCR缓冲液(1GCBuffer,2.5mmol/LMgCl2)中含模板DNA0.2g,引物0.20.5mol/L,dNTP为200mol/L,1UTaqDNA聚合酶,循环参数为99变性5min,85加酶,56退火1min,72延伸2min,然后951min,561min,722min,30个循环后72延伸7min。扩增产物在1%琼脂

10、糖凝胶中电泳,经EB染色在紫外光灯下观察结果并照相。 2结果 2.1-SEA、-3.7和-4.2缺失型突变的多重PCR扩增在PCR反应体系中同时扩增了2基因的一个1800bp的片段,用以判断样品DNA的2基因是否缺失,从而判断-地中海贫血突变患者是杂合子还是纯合子。无-SEA、-3.7和-4.2缺失型突变的正常人DNA样品经PCR扩增后只出现一条1800bp的2基因扩增片段;东南亚缺失型杂合子(-SEA/)的DNA样品经PCR扩增后除出现一条1800bp的2基因扩增片段外,还出现一条740bp的特异扩增片段;右侧缺失型杂合子(-3.7/)的DNA样品经PCR扩增后除出现一条1800bp的2基因

11、扩增片段外,还出现一条2022bp的特异扩增片段;右侧缺失型纯合子(-3.7/-3.7)的DNA样品经PCR扩增后只出现一条2022bp的特异扩增片段;左侧缺失型杂合子(-4.2/)的DNA样品经PCR扩增后除出现一条1800bp的2基因扩增片段外,还出现一条1628bp的特异扩增片段;左侧缺失型纯合子(-4.2/-4.2)的DNA样品经PCR扩增后只出现一条1628bp的特异扩增片段;右侧缺失型并左侧缺失型双重杂合子(-3.7/-4.2)的DNA样品经PCR扩增后同时出现2022bp和1628bp两条特异扩增片段。见图1。 !-empirenews.page-图1-SEA、-3.7和-4.2

12、缺失型突变的多重PCR检测结果(略) Fig1ThePCR-amplifiedresultof-SEA、-3.7、-4.2deletion 注:M为GeneRulerTMDNALadder(华美产品),泳道1-7对应的样本基因型分别为aa/aa,-SEA/,-3.7/,-3.7/-3.7,-4.2/,-4.2/-4.2,-3.7/-4.2。 M:Themarker(GeneRulerTMDNALadder).Thegenotyesofsamplescorrespondingtofromlane1tolane7wereaa/aa,-SEA/,-3.7/,-3.7/-3.7,-4.2/,-4.2/

13、-4.2,-3.7/-4.2. 2.2 海南汉、黎族人群中-地中海贫血(- SEA 、- 3.7 、- 4.2 )等位基因频率(见表1)。三种缺失在海南汉族人群中的频率分别为0.0127、0.0305和0.0203,在黎族人群中的频率分别为0.0075、0.1716和0.1891。两个人群中的三种缺失型-地中海贫血突变经 2 检验均符合Hardy-Weinbery遗传平衡。2.3 海南省汉、黎族人群中- SEA 、- 3.7 和- 4.2 缺失突变的基因型(见表2)。在197例海南汉族人中检出25例-地中海贫血携带者,携带率为12.69%,共发现- SEA /、- 3.7 /和- 4.2 /三

14、种基因型,其中- SEA /5例,- 3.7 /12例,- 4.2 /8例;在201例海南黎族人中检出114例-地中海贫血携带者,12下一页 携带率为56.72%,共发现- -SEA /、- 3.7 /、- 3.7 /- 3.7 、- 3.7 /- 4.2 、- 4.2 /和- 4.2 /- 4.2 六种基因型,其中- SEA /3例,- 3.7 /39例,- 3.7 /- 3.7 6例,- 3.7 /- 4.2 18例,- 4.2 /38例,- 4.2 /- 4.2 10例。 表1 海南省汉、黎族人群中三种-地中海贫血缺失突变的等位基因频率(略)Tab1 The allelic freque

15、ncies of three-thalassemia deletion mutation(- SEA 、- 3.7 、- 4.2 )in Han and Li nationalities of Hainan provinc 表2 海南省汉、黎族人三种缺失型-地中海贫血突变的基因型结果(略)Tab2 The genotypes of three-thalassemia deletion(- SEA 、- 3.7 、- 4.2 )in Han and Li nationalities of Hainan Province 3 讨论 -地中海贫血是一种遗传性溶血性血液疾病,也是世界上最常见的单基因遗传病之一,其主要特征是-珠蛋白链合成减少( + 地贫)或缺如( 0 地贫)。我国南方各省是该病的高发地区。因此,研究我国南方各省分的-地中海贫血的基因类型和频率分布,对开展遗传咨询和确定有效的普查法、产前诊断策略具有重要意义。 以聚合

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