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SNT 5227.10-2019 出口食品中貂源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA法).pdf

1、中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 5227.1020192019-12-27 发布2020-07-01 实施中 华 人 民 共 和 国 海 关 总 署发 布ICS 67.120.10X04出口食品中貂源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA法)Rapid detection of marten derived ingredient in food for exportRecombinase-aid amplification(RAA)method第10部分:出口食品中貂源性成分快速检测.indd 12020/1/16 21:52:34第10部分:出口食品中貂源性成分快速

2、检测.indd 22020/1/16 21:52:34ISN/T 5227.102019前 言SN/T XXXXXXXX出口食品中动物源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA法)预计分为以下部分:第 1 部分:出口食品中鸡源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 2 部分:出口食品中猪源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 3 部分:出口食品中羊源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 4 部分:出口食品中鸭源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 5 部分:出口食品中牛源性成分快速检测 重组

3、酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 6 部分:出口食品中水牛源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 7 部分:出口食品中马源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 8 部分:出口食品中驴源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 9 部分:出口食品中狐狸源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 10 部分:出口食品中貂源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 11 部分:出口食品中大鼠源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法)。本部分为 SN/T XXXXXXXX

4、 第 10 部分。本部分是根据 GB/T 1.12009 给出的规则起草。本部分由中华人民共和国海关总署提出并归口。本部分起草单位:中华人民共和国郑州海关、中华人民共和国成都海关、中华人民共和国拱北海关、中华人民共和国合肥海关、中国检验检疫科学研究院、中华人民共和国北京海关、中华人民共和国大连海关、中华人民共和国厦门海关、杭州众测生物科技有限公司。本部分主要起草人:苗丽、林华、罗宝正、陈静、宗凯、王娉、汪琳、郑秋月、徐淑菲、孔繁德、程奇。第10部分:出口食品中貂源性成分快速检测.indd 12020/1/16 21:52:34第10部分:出口食品中貂源性成分快速检测.indd 22020/1/

5、16 21:52:341SN/T 5227.102019出口食品中貂源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法)1 范围SN/T 52272019 的本部分规定了出口食品中貂源性成分的 RAA 检测方法。本部分适用于出口食品中貂源性成分的定性检测。2 规范性引用文件本部分所规定方法的最低检出限(LOD)为 0.1%(W/W)。下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法GB/T 274032008 实验室质量控制规范 食品

6、分子生物学检测3 术语和定义、缩略语3.1术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1.1 貂 Martes食肉目,裂脚亚目,鼬科,鼬亚科,貂属。常见的有以下几种:美洲貂、黄喉貂(青鼬)、石貂(榉貂)、松貂(林貂)、日本貂、渔貂、紫貂(黑貂)。我国产石貂、紫貂、渔貂、黄喉貂四种。3.1.2 实时荧光 RAA real-time RAA一种重组酶介导链替换的恒温核酸快速扩增技术(简称 RAA 技术)。利用从细菌或真菌中获得的重组酶,在恒温下(一般为 37 42),该重组酶可与引物紧密结合,形成酶和引物的聚合体,在单链 DNA 结合蛋白的帮助下,打开模板 DNA 的双链结构,当引物在模板 DNA

7、上搜索到与之完全匹配的互补序列时,在 DNA 聚合酶的作用下,形成新的 DNA 互补链,扩增产物以指数级增长。利用荧光探针的标记,随着 RAA 反应的进行,RAA 产物与荧光信号的增长呈现对应关系。3.1.3 Ct 值 cycle threshold每个反应管内的荧光信号达到设定阈值时所经历的循环数。3.1.4 T 值 time threshold每个反应管内荧光信号达到设定阈值时所需要的时间。第10部分:出口食品中貂源性成分快速检测.indd 12020/1/16 21:52:342SN/T 5227.1020193.2缩略语下列缩略语适用于本文件。BS-recA:枯草芽孢杆菌重组酶(Bac

8、illus subtilis recombinase)。Bsu:枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。CTAB:十六烷基三甲基溴化铵(cetyltrithylammonium bromide)。DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonuleic acid)。dNTPs:脱氧核苷三磷酸(deoxyribonuleoside triphosphate)。EDTA:乙二胺四乙酸(ethylene diaminetetraacetic acid)。RAA:重组酶介导扩增(recombinase-aid amplification)。SC-recA:天蓝色链霉菌重组酶(Streptomy

9、ces coelicolor recombinase)。SSB:单链 DNA 结合蛋白(single stranded DNA binding protein)。Tricine:N-三羟甲基甲基氨基酸(N-tris Hydroxymethyl methylglycine)。Tris:三羟甲基氨基甲烷 tris(Hydroxymethyl)aminomethane。4 方法提要以提取的 DNA 为模板,采用貂的特异性检测引物和探针进行实时荧光 RAA 扩增,根据实时荧光RAA 的增幅情况,实现对食品和饲料中貂成分的检测鉴定。5 试剂和材料除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂。实验用水符合

10、GB/T 6682 的要求。所有试剂均用无 DNA 酶污染的容器分装。表 1 检测用引物和探针物种名称引物/探针序列(5 3)扩增片段长度靶基因貂F:ATTCTCACCTGACCTGTTAGGAGACCCAGAC269bp线粒体细胞色素b 基因(Cytb)R:TAAGGAGATCAGCTACTAGTAATCAGAACAAGCP:ACTTCCTATTCGCATATGCTATCCTACGAFAM-dTCTHFABQH-dTCCCTAATAAACTAG-C3spacer 注:目的基因序列参见附录 A。F 为上游引物,R 为下游引物,P 为探针,FAM-dT,THF,BQH-dT 和 C3spacer

11、均为探针修饰基团。5.1 CTAB 提取缓冲液(pH8.0):10 g/L CTAB,0.7 mol/L NaCl,0.05 mol/L Tris-HCl,0.01 mol/L Na2EDTA。5.2 酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。5.3 异丙醇。5.4 70%乙醇(体积比)。5.5 TE 缓冲液(pH8.0):10 mmol/L Tris-HCl(pH8.0),1 mmol/L EDTA(pH8.0)。第10部分:出口食品中貂源性成分快速检测.indd 22020/1/16 21:52:343SN/T 5227.1020195.6 缓冲液 A:20%聚乙二醇。5.7 实时荧光 RAA 扩

12、增体系:2.5 mmol/L dNTPs,225 ng/L SSB,300 ng/L recA 重组酶蛋白(SC-recA/BS-recA),75 ng/L Bsu DNA 聚合酶,75 ng/L Exo 核酸外切酶,250 mmol/L Tricine,12.5 mmol/L 二硫苏糖醇,250 ng/L 肌酸激酶。也可以使用等效的商品化的试剂盒代替。5.8 缓冲液 B:280 mol/L 醋酸镁。6 仪器设备6.1实时荧光 PCR 仪。6.2恒温荧光检测仪。6.3核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计。6.4恒温水浴锅。6.5离心机:转速大于等于 12 000 r/min。6.6微量移液器:量程

13、0.5 L10 L,10 L100 L,20 L200 L,200 L1000 L。6.7研钵及粉碎装置。6.8涡旋振荡器。6.9离心管:2mL、1.5mL。7 检测步骤7.1 DNA 提取取 0.2 g 粉碎或磨碎的样品至一洁净的 1.5 mL 离心管中(6.9)(若样品含杂质和调味品,可加入1 mLdd H2O 洗涤两次),加入 600 L CTAB 提取缓冲液(pH 8.0)(5.1),涡旋振荡混匀后于 70 温育 15 min,期间颠倒离心管 23 次;12 000 r/min 离心 5 min,取上清液于一新的干净 1.5 mL 离心管中;加入 500 L 酚:氯仿:异戊醇(25:2

14、4:1)(5.2),上下颠倒离心管 23 次后涡旋振荡混匀,12 000 r/min 离心 5 min;转移上层水相至一新的 1.5 mL 离心管中,加入 0.7 倍体积异丙醇(5.3),上下颠倒离心管 23 次,4 静置 30 min,4 下 12 000 r/min 离心 3 min,小心弃去上清液;加入 700 L 70%乙醇(5.4),重悬沉淀,12 000 r/min 离心 1 min,小心弃去上清液;打开管盖,室温挥发干液体,加入 50 L100 L TE 缓冲液(pH8.0)(5.5)溶解 DNA,-20 保存备用。DNA 提取也可采用等效DNA 提取试剂盒进行。7.2 DNA

15、浓度和纯度的测定使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计分别检测 260 nm 和 280 nm 处的吸光值 A260和 A280。DNA的浓度按照式(1)计算:c=AN50/1000 (1)式中:cDNA 浓度,单位为微克每微升(g/L);A260 nm 处的吸光值;N核酸稀释倍数。当 A260/A280比值在 1.71.9 之间时,适宜于 RAA 扩增。第10部分:出口食品中貂源性成分快速检测.indd 32020/1/16 21:52:344SN/T 5227.1020197.3 实时荧光 RAA 扩增7.3.1 实时荧光 RAA 反应总体系见表 2。表 2 实时荧光 RAA 反应总体系试剂体

16、积/L实时荧光 RAA 扩增体系(5.7)20缓冲液 A(5.6)12.5正向引物(10 mol/L)2.0反向引物(10 mol/L)2.0探针(10 mol/L)0.6DNA 模板(5 ng/L)2.0缓冲液 B(5.8)2.5加 ddH2O 至507.3.2 实时荧光 RAA 反应程序7.3.2.1 实时荧光 PCR 仪39,60 s,1 个循环;39,30 s,40 个循环,在每次循环时收集荧光。7.3.2.2 恒温荧光检测仪39,1 min;39,20 min,第二阶段开始收集荧光。7.3.3 实验对照检测过程中分别设阳性对照、阴性对照、空白对照。采用含有貂源成分的样品作为阳性对照样品,不含貂源成分的样品作为阴性对照样品,以与模板等体积的双蒸水作为空白对照样品。8 质量控制8.1 实时荧光 PCR 仪8.1.1 空白对照:无荧光对数增长,相应的无报告 Ct 值。8.1.2 阴性对照:无荧光对数增长,相应的无报告 Ct 值。8.1.3 阳性对照:有荧光对数增长,且荧光通道出现典型的扩增曲线,相应的 Ct 值小于等于 30.0。8.2 恒温荧光检测仪8.2.1 空白对照:无荧光对

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