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SNT 1543-2005 食源性致病菌基因芯片鉴定方法.pdf

1、SN/T1543-2005表1PCR扩增产物长度名称扩增产物长度阳性参照(细菌共同探针)约128(9541081阴性对照(军团菌探针)无扩增产物空白对照1(水)无扩增产物空白对照2(不点样)无扩增产物金黄色葡萄球菌314(24337)单增李斯特菌314(1314)霍乱孤菌128(9371064)副溶血性孤菌103(458560)沙门氏蓝属384(测序得到)肠炎沙门氏菌298(测序得到)弯曲属131(9001030)E.coli O157:H7103(469571)小肠结肠炎耶尔森氏菌138(9171044)福氏志贺氏菌306(4965)5.2基因芯片检测所用探针序列霍乱弧菌:5-NH2-(T)

2、12 CTCCAGCGTCTCCGCTAGATTC3弯曲菌属:5-NH2-(T)12-TCTAGCAAGCTAGCACCCTCATATC-3耶尔森氏菌:5-NH2(T)12-CTAAAGCATCTCTGCTAAATTCCGTGG-3E.coli 0157:H7:5-NH2-(T)12-GCAGTCACCCCATAAAAGAGGCT-3副溶血性弧菌:5-NH2-(T)12-GGTACGCAGTCACAGGACAAAGCC-3福氏志贺氏菌:5-NH2-(T)12 GCGAAACAGCAAGCTGCTTCC3单增李斯特菌:5-NH2-(T)12-CGATAGCCGAAACAATATTACAAAAGC

3、GTGG-3金黄色葡萄球菌:5-NH2-(T)12 CGACAAGAGCGTATTACACTTTTGAACCATCCGG3沙门氏菌属:5-NH2-(T)12-GCTTCTCATCGACAACCTAACTTCTGCGCC-3肠炎沙门氏菌:5-NH2-(T)12-TTTTCCGTGGGCGTATTCA-3真细菌:5-NH2-(T)12-GGATGTCAAGAGTAGGTAAGGTTCTTCGCG-3阴性对照(军团菌)5-NH2(T)12-ATAGCATTGGTGCCGATTTGGGGAAGA-35.3主要试剂除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂。5.3.1基因组DNA提取试剂盒。5.3.2溶菌素、溶葡萄球菌素。5.3.3PCR扩增试剂盒。5.3.4基因芯片杂交试剂盒和基因芯片显色试剂盒。5.3.5琼脂糖:电泳纯。5.3.6溴化乙锭。5.3.7DNA分子量标记:50bp300bp。5.3.8TAE电泳缓冲液储备液(X50):称取60.5 g Tris碱、14.725mL冰乙酸、25mL0.5mol/L EDTA(pH8.0),用蒸馏水定容250mL,混匀,室温保存,使用时,用蒸馏水做50倍稀释即刻。3

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