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LncRNA案例教学课件.pdf

1、NSFC案例精讲班(一)解螺旋课堂2017酸菜解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂0课 程 内 容文献案例分析科学假设模式132标书写作讲解解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析图1.lncRNA MVIH在40例HCC中高表达,表达框定位于RPS24基因,但与该基因表达没有相关性表1.在215例HCC组织样本中lncRNA MVIH表达与其他临床病理因素的多因素分析图2.lncRNA MVIH是HCC中独立的RFS与OS预测因子解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解

2、 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析图3.lncRNA MVIH在动物模型中具有促进HCC肿瘤生长和肝内转移的功能作用图4.RNA pulldown+MS鉴定筛选到与lncRNA MVIH相互作用的蛋白PGK1解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析图5.lncRNA MVIH通过抑制PGK1蛋白的分泌影响HCC肿瘤血管形成表型图6.lncRNA MVIH和PGK1的表达在组织标本中呈负相关,且与MVD相关解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析HCCPGK1分泌生长,转移,血管生成肿瘤血管生成MVIH科学假设:逻辑思

3、路:AlncRNA MVIH临床意义Fig.1,2Tab.1lncRNA MVIH血管形成临床意义BFig.3PGK1ClncRNA MVIHFig.4PGK1lncRNA MVIH血管形成DFig.5EPGK1lncRNA MVIH血管形成临床意义Fig.6解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析图1.LncRNA AF147447表达与幽门螺杆菌感染相关图2.抑制LncRNA AF147447在体外、体内促进胃癌细胞增殖和迁移图3.过表达LncRNA AF147447在体外、体内

4、抑制胃癌细胞增殖和迁移解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析图4.RNA pulldown+MS鉴定筛选到与LncRNA AF147447相互作用的蛋白MUC2已知癌基因图5.MUC2表达与幽门螺杆菌表达正相关,且与LncRNA AF147447表达负相关(组织)解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂1文 献 案 例 分 析图6.LncRNA AF147447与MUC2可竞争性地与miR-34c结合,发挥ceRNA功能图7.LncRNA AF147447启动子能够被转录因子蛋白E2F1负向调控解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课

5、堂1文 献 案 例 分 析GCMUC2增殖,迁移幽门螺杆菌AF147447科学假设:AlncRNA AF147447临床意义(幽门螺杆菌感染)Fig.1lncRNA AF147447增殖迁移临床意义BFig.2,3MUC2ClncRNA AF147447Fig.4MUC2lncRNA AF147447幽门螺杆菌DFig.5E2F1逻辑思路:EMUC2lncRNA AF147447Fig.6miR-34cFMUC2lncRNA AF147447miR-34cE2F1Fig.7解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂2科 学 假 设 模 式延伸机制疾病临床问题科学热点分子(X)机制(Y

6、)效应(Z)12345前期工作研究兴趣申请人方向lncRNA蛋白功能A转录因子lncRNABmiRNA蛋白C解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂3标 书 写 作 讲 解案例(一)1)题目:lncRNA-MALAT1靶向ANKHD1调控Hippo信号通路影响大肠癌放射敏感性的机制研究大肠癌ANKHD1Hippo通路放射敏感性MALAT12)假设:1大肠癌新辅助放疗能够显著改善治疗效果,但存在敏感性问题LncRNA MALAT1能够调控大肠癌细胞的放射敏感性2MALAT1能够靶向调节ANKHD1的表达,从而影响Hippo通路34Hippo信号通路异常是肠癌细胞放疗抵抗的重要分子机制

7、5本项目拟开展工作3)立项依据:Mini-review600-800 字Mini-review800-1000 字Mini-review600-800 字Mini-review400-600 字400 字解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂3标 书 写 作 讲 解案例(一)4)研究内容与研究目的:1 在放疗耐受的肠癌细胞中抑制MALAT1表达,观察其对射线敏感性的影响,检测细胞功能表型变化细胞水平2 分子水平阐明MALAT1靶向调节ANKHD1表达的分子机制,基于Hippo信号通路探讨MALAT1下游分子途径3 在体内动物模型中评估MALAT1对放疗敏感性的作用,并验证ANKH

8、D1和Hippo通路表达改变动物水平4 临床水平利用大规模的组织样品分析MALAT1表达与肠癌患者放疗抵抗之间的相关性,揭示其临床意义123体外结合体内研究明确lncRNA MALAT1影响肠癌放疗敏感性的功能作用理解MALAT1对靶基因ANKHD1调节的分子机制,以及其对Hippo通路的影响证实MALAT1在临床上作为大肠癌新辅助放疗抵抗分子标志物的转化应用价值解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂3标 书 写 作 讲 解案例(一)5)研究创新点6)拟解决关键科学问题123MALAT1能够调节肠癌细胞放疗敏感性MALAT1通过ANKHD1影响Hippo信号通路MALAT1作为肠

9、癌新辅助放疗的分子标志物123MALAT1在肠癌中影响放疗敏感的功能MALAT1在肠癌中影响放疗敏感的分子机制MALAT1能否在临床上指导肠癌的放疗敏感性解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂3标 书 写 作 讲 解案例(二)1)题目:心肌纤维化新机制:LncRNA(n287665)-miRNA(let-7d)-PAFR/YAP1缺血性心肌病let-7dPAFR/YAP1心肌纤维化n28776652)假设:1心肌纤维化是引发缺血性心肌病的重要形成机制申请人前期筛选发现LncRNA n287665能够促进心肌纤维化2n287665以内源性竞争RNA的形式结合miRNA let-7d

10、34let-7d可调控PAFR和YAP1,从而影响心肌纤维化作用5本项目拟开展工作3)立项依据:Mini-review600-800 字Mini-review800-1000 字Mini-review400-600 字Mini-review600-800 字400 字解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂3标 书 写 作 讲 解案例(二)4)研究内容与研究目的:1 采用过表达和RNAi干扰研究LncRNA n287766在心肌纤维化中的功能作用,探讨其与凋亡/炎症的关系细胞水平2 分子水平阐明LncRNA n287665 let-7d-PAFR/YAP1调控的分子机制,确认结合位

11、点和序列特性3 在体内动物模型中探讨LncRNA n287665对心肌纤维化的作用,并验证其调控的分子信号通路动物水平123揭示在心肌纤维化中LncRNA n287766分子执行的功能效应阐明n287665 let-7d-PAFR/YAP1具体的调控分子机制通过体内实验验证LncRNA n287665影响心肌纤维化的表型及分子途径解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂解 螺 旋 课 堂3标 书 写 作 讲 解案例(二)5)研究创新点6)拟解决关键科学问题123首次发现LncRNAn287665能够介导心肌纤维化作用首次发现LncRNAn287665 let-7d-PAFR/YAP1分子通路证实LncRNA n287665 let-7d-PAFR/YAP1通路对心肌纤维化的意义12LncRNA n287665在心肌纤维化中的功能LncRNA n287665靶向调节let-7d及影响下游PAFR/YAP1的作用机制解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂THANKS2016-12-21解螺旋课堂 解螺旋课堂 解螺旋课堂

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