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SNT 5227.3-2019 出口食品中羊源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA法).pdf

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资源描述

1、以正式出版文本为准中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 5227.32019出口食品中羊源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA法)Rapid detection of sheep and goat derived ingredients in food for exportRecombinase-aid amplification(RAA)method2019-12-27 发布2020-07-01 实施ICS 67.050C 53中华人民共和国海关总署发 布以正式出版文本为准以正式出版文本为准SN/T 5227.32019I前 言SN/T 52272019出口食品中动物源

2、性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA法)分为 11 个部分:第 1 部分:出口食品中鸡源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 2 部分:出口食品中猪源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 3 部分:出口食品中羊源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 4 部分:出口食品中鸭源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 5 部分:出口食品中牛源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 6 部分:出口食品中水牛源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 7

3、部分:出口食品中马源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 8 部分:出口食品中驴源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 9 部分:出口食品中狐狸源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 10 部分:出口食品中貂源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法);第 11 部分:出口食品中大鼠源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法)。本部分为 SN/T 52272019 的第 3 部分。本部分按照 GB/T 1.12009 的规则进行编写。本部分由中华人民共和国海关总署提出并归口。本部分起草单位:中华

4、人民共和国郑州海关、中华人民共和国合肥海关、中国检验检疫科学研究院、浙江省食品药品检验研究院、中华人民共和国杭州海关、中华人民共和国拱北海关、中华人民共和国厦门海关、中华人民共和国北京海关、中华人民共和国大连海关。本部分主要起草人:苗丽、宗凯、王娉、沈泓、张九凯、吴姗、罗宝正、孔繁德、汪琳、郑秋月、徐淑菲。以正式出版文本为准以正式出版文本为准1SN/T 5227.32019出口食品中羊源性成分快速检测 重组酶介导链替换核酸扩增法(RAA 法)1 范围本部分规定了出口食品中羊源性成分的 RAA 检测方法。本部分适用于出口食品中羊源性成分的定性检测。此标准所规定方法的最低检出限(LOD)为 0.1

5、%(W/W)。2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法GB/T 274032008 实验室质量控制规范 食品分子生物学检测3 术语、定义和缩略语3.1术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1.1 羊 Ovis aries&Capra hircus哺乳纲、偶蹄目、牛科、羊亚科、羊族。羊族有4属,分别为绵羊属,山羊属,塔尔羊属和岩羊属。3.1.2 实时荧光 RAA real-time RAA一种重组酶介导链替换的

6、恒温核酸快速扩增技术(简称 RAA 技术)。利用从细菌或真菌中获得的重组酶,在恒温下(一般为 37 42),该重组酶可与引物紧密结合,形成酶和引物的聚合体,在单链 DNA 结合蛋白的帮助下,打开模板 DNA 的双链结构,当引物在模板 DNA 上搜索到与之完全匹配的互补序列时,在 DNA 聚合酶的作用下,形成新的 DNA 互补链,扩增产物以指数级增长。利用荧光探针的标记,随着 RAA 反应的进行,RAA 产物与荧光信号的增长呈现对应关系。3.1.3 Ct 值 cycle threshold每个反应管内的荧光信号达到设定阈值时所经历的循环数。3.1.4 T 值 Time threshold每个反应

7、管内荧光信号达到设定阈值时所需要的时间。3.2缩略语下列缩略语适用于本文件。以正式出版文本为准2SN/T 5227.320193.2.1RAA:recombinase-aid amplification,重组酶介导扩增。3.2.2DNA:deoxyribonuleic acid,脱氧核糖核酸。3.2.3CTAB:cetyltrithylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵。3.2.4Tris:tris(Hydroxymethyl)aminomethane,三羟甲基氨基甲烷。3.2.5EDTA:ethylene diaminetetraacetic acid,乙二胺四乙酸。3.

8、2.6dNTPs:deoxyribonuleoside triphosphate,脱氧核苷三磷酸。3.2.7SSB:single stranded DNA binding protein,单链 DNA 结合蛋白。3.2.8SC-recA:Streptomyces coelicolor recombinase,天蓝色链霉菌重组酶。3.2.9BS-recA:Bacillus subtilis recombinase,枯草芽孢杆菌重组酶。3.2.10Bsu:Bacillus subtilis,枯草芽孢杆菌。3.2.11Tricine:N-tris Hydroxymethyl methylglycin

9、e,N-三羟甲基甲基氨基酸。4 方法提要以提取的 DNA 为模板,采用羊的特异性检测引物和探针进行实时荧光 RAA 扩增,根据实时荧光RAA 的增幅情况,实现对食品和饲料中羊成分的检测鉴定。5 试剂和材料除另有规定外,所有试剂均为分析纯或生化试剂。实验用水符合 GB/T 6682 的要求。所有试剂均用无 DNA 酶污染的容器分装。表 1 检测用引物和探针物种名称引物/探针序列(5 3)扩增片段长度靶基因羊F:TTGGVTCYCTCCTAGGMATTTGCYTAATYTTAC229bp线粒体细胞色素b 基因(Cytb)R:AARGTRTATGATCCRTARTATAGRCCTCGTCP:ATGC

10、TGTTGTTGTGTCAGGTGTATAGTG FAM-dTTHFT BQH-dT GCTAGGAATAGGC-C3spacer 注:目的基因序列见附录 A。F 为上游引物,R 为下游引物,P 为探针,FAM-dT,THF,BQH-dT 和 C3spacer均为探针修饰基团。5.1 CTAB 提取缓冲液(pH8.0):10 g/L CTAB,0.7 mol/L NaCl,0.05 mol/L Tris-HCl,0.01 mol/L Na2EDTA。5.2 酚:氯仿:异戊醇=25:24:1。5.3 异丙醇。5.4 70%乙醇(V/V)。5.5 TE 缓冲液(pH8.0):10 mmol/L T

11、ris-HCl(pH8.0),1 mmol/L EDTA(pH8.0)。5.6 A Buffer(缓冲液 A):20%聚乙二醇。5.7 实时荧光 RAA 扩增体系:2.5 mmol/L dNTPs,225 ng/L SSB,300 ng/L recA 重组酶蛋白(SC-以正式出版文本为准3SN/T 5227.32019recA/BS-recA),75 ng/L Bsu DNA 聚合酶,75 ng/L Exo 核酸外切酶,250 mmol/L Tricine,12.5 mmol/L 二硫苏糖醇,250 ng/L 肌酸激酶。也可以使用等效的商品化的试剂盒代替。5.8 B Buffer(缓冲液 B)

12、:280 mM 醋酸镁。6 仪器设备6.1 实时荧光 PCR 仪。6.2 恒温荧光检测仪。6.3 核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计。6.4 恒温水浴锅。6.5 离心机:转速 12 000 r/min。6.6 微量移液器:量程 0.5 L10 L,10 L100 L,20 L200 L,200 L1 000 L。6.7 研钵及粉碎装置。6.8 涡旋震荡器。6.9 离心管:2 mL、1.5 mL。7 检测步骤7.1 DNA 提取取 0.2 g 粉碎或磨碎的样品至一洁净的 1.5 mL 离心管中(若样品含杂质和调味品,可加入 1 mLdd H2O 洗涤两次),加入 600 L CTAB 提取缓冲液,涡

13、旋震荡混匀后于 70 温育 15 min,期间颠倒离心管 2 次 3 次;12 000 r/min 离心 5 min,取上清于一新的干净 1.5 mL 离心管中;加入 500 L 酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),上下颠倒离心管 2 次 3 次后涡旋震荡混匀,12 000 r/min 离心 5 min;转移上层水相至一新的 1.5 mL 离心管中,加入 0.7 倍体积异丙醇,上下颠倒离心管 2 次 3 次,4 静置 30 min,4 下 12 000 r/min 离心 3 min,小心弃去上清液;加入 700 L 70%乙醇,重悬沉淀,12 000 r/min 离心 1 min,小心弃去上清

14、液;打开管盖,室温挥发干液体,加入 50 L100 L TE(pH8.0)缓冲液溶解 DNA,-20 保存备用。DNA 提取也可采用等效 DNA 提取试剂盒进行。7.2 DNA 浓度和纯度的测定使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计分别检测260 nm和280 nm处的吸光值A260和A280。DNA的浓度按照公式(1)计算:c=AN50/1000 (1)公式中:c=DNA 浓度,单位为微克每微升(g/L);A=260 nm 处的吸光值;N=核酸稀释倍数。当 A260/A280比值在 1.71.9 之间时,适宜于 RAA 扩增。以正式出版文本为准4SN/T 5227.320197.3 实时荧光 R

15、AA 扩增7.3.1 实时荧光 RAA 反应总体系表 2 实时荧光 RAA 反应总体系试剂体积/L实时荧光 RAA 扩增体系20 LA Buffer12.5 L正向引物(10 M)2.0 L反向引物(10 M)2.0 L探针(10 M)0.6 LDNA 模板(5 ng/L)2.0 LB Buffer2.5 L加 ddH2O 至50 L7.3.2 实时荧光 RAA 反应程序可选用以下两种扩增仪器之一进行检测,反应程序对应如下。7.3.2.1 实时荧光 PCR 仪39,60 s,1 个循环;39,30 s,40 个循环,在每次循环时收集荧光。7.3.2.2 恒温荧光检测仪39,1 min;39,2

16、0 min,第二阶段开始收集荧光。7.3.3 实验对照检测过程中分别设阳性对照、阴性对照、空白对照。采用含有羊源成分的样品作为阳性对照样品,不含羊源成分的样品作为阴性对照,以与模板等体积的双蒸水作为空白对照。8 质量控制8.1 实时荧光 PCR 仪8.1.1 空白对照:无荧光对数增长,相应的无报告 Ct 值。8.1.2 阴性对照:无荧光对数增长,相应的无报告 Ct 值。8.1.3 阳性对照:有荧光对数增长,且荧光通道出现典型的扩增曲线,相应的 Ct 值 30.0。8.2 恒温荧光检测仪8.2.1 空白对照:无荧光对数增长,相应的无报告 T 值(时间)。8.2.2 阴性对照:无荧光对数增长,相应的无报告 T 值(时间)。8.2.3 阳性对照:有荧光对数增长,且荧光通道出现典型的扩增曲线,相应的 T 值(时间)15min。以正式出版文本为准5SN/T 5227.320199 结果判断与表述9.1 结果判定9.1.1 实时荧光 PCR 仪9.1.1.1 在符合条款 8.1 的情况下,结果才能判为有效。9.1.1.2 如 Ct 值 35.0,则判定被检样品阳性。9.1.1.3 如 35.0 C

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