1、大豆磷铁养分胁迫响应大豆磷铁养分胁迫响应的的 FER 基因鉴定基因鉴定及及 FER1 缓解铁毒作用缓解铁毒作用吴丽霞,欧斯艳,麦翠珊,黄丽雅,张亚楠,邓雅茹,李方剑,王金祥*(华南农业大学根系生物学中心/广东省农业农村污染治理与环境安全重点实验室/华南农业大学资源环境学院,广东广州510642)摘要:【目的目的】FERRITIN(FER)是一类保守铁蛋白,对于维持铁的稳态及铁代谢中起重要作用。通过鉴定大豆FERRITIN(GmFER)基因家族的组成及其对低磷、铁毒等养分胁迫的响应,为今后研究 FER 功能奠定基础。【方法方法】对 GmFER 基因进行生物信息学分析,根据其编码的 GmFER 氨
2、基酸序列,用 ProtParamtool 网站计算了 GmFER 家族的相对分子质量、氨基酸组成和等电点(PI);用 PSORT 网站预测 GmFERs 蛋白定位;从Phytozome 网站下载 GmFER 家族的氨基酸序列与基因启动子序列,用MEME预测 GmFER 家族序列中的保守基序;用 MEGAX 对 GmFERs 进行进化分析,用最大似然法重建进化树;通过定量 PCR 分析 GmFER 对低磷、铁毒等养分胁迫的响应,构建 GmFER1 基因启动子融合 GUS报告基因的载体与 GmFER1 超表达载体,进一步分析 GmFER1 基因启动子活性和对铁毒的响应,以及异源超表达 GmFER1
3、 对拟南芥耐受铁毒的影响。【结果结果】大豆基因组有 12 个 GmFER 基因,对 GmFERs 进行进化分析,发现 GmFERs 可以分为 4 个亚组(亚组),其中 GmFER3、GmFER7、GmFER8、GmFER10 和 GmFER11 属于亚组,GmFER2 和 GmFER9 同属亚组;GmFER5 和禾本科植物水稻和玉米的 FER 同属亚组,GmFER1、GmFER4、GmFER6、GmFER12属于亚组;通过 MEME 预测,GmFER 家族序列中的保守基序有 3 个;蛋白亚细胞定位预测显示,大豆FER 蛋白可定位于细胞质、线粒体和叶绿体。运用定量 PCR 技术检测 GmFER
4、基因在大豆根和叶的表达水平,发现 12 个 GmFER 基因在响应磷铁养分胁迫时存在差异,其中 GmFER1、GmFER4、GmFER5、GmFER6、GmFER12 受低磷诱导,GmFER1、GmFER4、GmFER12 表达受铁毒诱导;对 GmFER1 启动子的活性进行分析,发现铁毒促进 GmFER1 启动子在根系的活性;在铁毒胁迫下,与野生型 Col-0 比,超表达 GmFER1 显著提高了拟南芥的主根长、侧根数目、侧根密度、叶绿素含量和鲜重,增强了耐铁毒的能力。【结论结论】大豆基因组共有 12 个 FER 基因,GmFER 基因响应低磷或铁毒等养分胁迫。超表达 GmFER1 可促进主根
5、生长,增加侧根密度,提高叶绿素含量,增加植株鲜重,表明 GmFER1 在缓解铁毒胁迫方面起重要作用。关键词:FERRITIN;GmFER 基因组;大豆;低磷胁迫;铁毒害;根系发育;叶绿素含量Responses of FER family genes in Glycine max to low phosphorus stressand iron toxicity and the role of GmFER1 in iron toxicity toleranceWULi-xia,OUSi-yan,MAICui-shan,HUANGLi-ya,ZHANGYa-nan,DENGYa-ru,LIFang
6、-jian,WANGJin-xiang*(Root Biology Center/Guangdong Provincial Key Laboratory of Agricultural&Rural Pollution Abatement and EnvironmentalSafety/College of Natural Resources and Environment,South China Agricultural University,Guangzhou,Guangdong 510642,China)Abstract:【Objectives】FERRITIN(FER)isakindof
7、conservedferritin.FERplaysimportantrolesinmaintainingironionhomeostasisandironmetabolism.WeidentifiedGlycine max FERRITIN(FER)genes,determinedtheresponsesofGmFERstolowPstressandFetoxicity,anddecipheredtherolesofGmFER1iniron植物营养与肥料学报2023,29(1):8196doi:10.11674/zwyf.2022046JournalofPlantNutritionandFe
8、rtilizershttp:/www.plantnutrifert.org收稿日期:20220124接受日期:20220517基金项目:广东省科技计划项目(2021B1212040008);国家重点研发项目(2021YFF1000500);华南农业大学 2019 年大学生创新创业训练计划项目(201910564201)。联系方式:吴丽霞E-mail:;*通信作者王金祥E-mail:toleranceviaheterologousexpression.【Methods】TheGmFERgeneswereidentifiedviabioinformaticstechnique.Basedonthe
9、encodedaminoacidsequenceofGmFERs,therelativemolecularweight,aminoacidcompositionandisoelectricpoint(PI)ofGmFERfamilywerecalculatedbyProtParamprogram.ThesubcellularlocalizationofGmFERswaspredictedbyPSORT.TheMEMEsuitewasusedtoexploretheconservedmotifsinGmFERfamily.Thephylogenetictreewasreconstructedby
10、maximumlikelihoodmethodviaMEGAX.QuantitativerealtimePCRwasusedtoanalyzetheresponsesofGmFERstolowphosphorus(P)andirontoxicity.WeconstructedthevectorofGmFER1genepromoterfusedwithGUSreportergeneandoverexpressingGmFER1vector,andfurtheranalyzedthepromoteractivityofGmFER1geneanditsresponsetoirontoxicityin
11、Arabidopsis,aswellastheeffectonArabidopsis thalianatolerancetoirontoxicity.【Results】Soybeangenomeencodes12FERs.GmFERscanbedividedintofoursubgroups(subgroups),amongwhichGmFER3,GmFER7,GmFER8,GmFER10andGmFER11belongtosubgroup,GmFER2andGmFER9belongtosubgroup;togetherwithFERsfromgramineousriceandmaize,Gm
12、FER5belongstosubgroup,andGmFER1,GmFER4,GmFER6,andGmFER12belongtosubgroup.TheMEMEsuitepredictedthattherewerethreeconservedmotifsintheGmFERfamily.SubcellularlocalizationpredictionrevealedthatGmFERsappeartobelocalizedincytoplasm,mitochondriaandchloroplast.QuantitativerealtimePCRanalysisshowedthat12GmFE
13、RgenesweredifferentiallyresponsivetoPandironnutrientstress.Amongthem,GmFER1,GmFER4,GmFER5,GmFER6andGmFER12wereinducedbylowP,andtheexpressionofGmFER1,GmFER4,andGmFER12wasinducedbyirontoxicity.IrontoxicitypromotedtheactivityofGmFER1promoterinroots.Underirontoxicitystress,comparedwithwild-typeCol-0,ove
14、rexpressingGmFER1significantlyincreasedthelengthofprimaryroot,numberoflateralroots,lateralrootdensity,chlorophyllcontent,andfreshweightofArabidopsis,thusenhancingirontoxicityresistance.【Conclusions】Soybeangenomeencodes12GmFERs.GmFERgenesrespondtolowPorirontoxicity.OverexpressionofGmFER1improvesthegr
15、owthoftransgenicArabidopsisunderirontoxicityviapromotingprimaryrootgrowth,lateralrootformation,increasinglateralrootdensity,chlorophyllcontentandfreshweight.OurresultsindicatethatGmFER1playsimportantrolesinalleviatingirontoxicitystressandenhancingtheabilityofplantstotolerateirontoxicity.Key words:FE
16、RRITIN;GmFERgenome;Glycine max;lowphosphorusstress;irontoxicity;rootdevelopment;chlorophyllcontent铁是植物必需的微量元素,但细胞内铁的含量过高,则会因铁的强氧化能力产生氧化胁迫1,因此铁的吸收和利用必须精确调控,才能维持植物细胞内铁稳态。双子叶植物如拟南芥(Arabidopsisthaliana)和番茄(Solanum lycopersicum)采用机制进行铁吸收,三价铁被还原为二价铁后通过根细胞膜上的铁转运子进入根细胞;在低铁环境下通过增加根的还原能力,促进质子的外排和还原剂的释放,促进铁的吸收2。番茄转录因子 Fer 是最早被鉴定的关键铁营养调节因子,它是一个细胞核定位的bHLH 蛋白3。Fer 在番茄根尖的表达不依赖于铁的供应,其在转录水平调节番茄根的发育和生理进而调节铁营养。FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR(FIT)是拟南芥铁信号网络的核心转录因子,FIT 与 bHLH38/39/100/101 互作而调控下