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DB32T 1775-2011 Ⅰ型鸭肝炎病毒的检测 RT-PCR方法.pdf

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资源描述

1、ICS 65.020.30B 41备案号:江苏省地方标准DBDBDBDB32323232DB32/T17752011型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR 方法Method of RT-PCR detecting Duck Virus Hepatitis I2011-05-06 发布2011-07-06 实施江苏省质量技术监督局发布DB32/T 17752011I前言为规范型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术,提高鸭肝炎病毒检测的灵敏度、稳定性、特异性,特制定本标准。本标准按 GB/T 1.1-2009标准化工作导则 第 1 部分:标准结构和编写编制。本标准的附录 A 为规范性附录。本标准由江苏省农业科学院

2、提出。本标准起草单位:江苏省农业科学院。本标准起草人:魏雪涛、李银、刘宇卓、张敬峰。DB32/T 177520111型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR 方法1范围本标准规范了型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术RT-PCR的所用引物大小、所涉及的样品范围、操作流程、反应条件等技术标准。本标准适用于检测鸭肝脏和病毒尿囊液中 I 型鸭肝炎病毒核酸。2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的,凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T 6682-2008分析实验室用水规格和试验方法NY/T 541-2002动物疫病实验

3、室检验采样3方法原理聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。PCR技术却以其快速、敏感和特异等优点在动物疫病检测中得到广泛应用,而且随着PCR技术的不断改进,这种针对病原核酸的诊断方法表现出更准确、灵敏和特异的特点。本标准选取了DHV I VP1基因的保守,设计了一对特异性引物,经过了PCR条件的优化、特异性实验、敏感性试验等,对DHV I的鉴定具有很高的准确性。4仪器设备和主要试剂4.1仪器设备:PCR仪,离心机,电泳槽,微量移液器,凝胶成像系统4.2主要试剂:TRIZO

4、L,氯仿,异丙醇,无水乙醇,焦碳酸二乙酯(DEPC)处理的灭菌双蒸水,AMV反转录酶,5AMV Buffer,10 mmol/L dNTPs,RNA酶抑制剂,25 mmol/L MgCl2,EX Taq DNA聚合酶,10EX Taq DNA聚合酶buffer,2.5 mmol/L dNTP,DNA Marker DL-2000,琼脂糖。5引物上游引物:5-ATCTAATGTCCCGATACAAGGTG-3;下游引物:5-ACGCTAGTGTTTTGAGTCTAAGGC-3。6样品采集按照NY/T 541-2002动物疫病实验室检验采样方法,病死或扑杀鸭,无菌采集肝脏组织。7方法步骤DB32/

5、T 177520112试验用水:按照GB-T 6682-2008 三级水标准7.1样品处理取病料0.5g1g置研钵中剪碎并研磨,反复冻融研磨,将研磨好的组织,用生理盐水15稀释,以4 12000 r/min 离心10 min,取上清200 L备用。阴性对照:没有发病的正常鸭肝脏阳性对照:用中和试验检测DHV阳性肝脏样品(见附录A)7.2DHV RNA 的提取取已处理的待检样品,以DHV阳性病毒为阳性对照,以正常肝脏作为阴性对照,无菌水为空白对照,每管依次加入Trizol600L,振荡混匀后,室温放置10 min,加入氯仿200 L,剧烈振荡后,室温放置1 min,4 12000 r/min,离

6、心15 min,取上层水相750 L,加入500 L异丙醇,混匀,20放置15 min,4 12000 r/min,离心15 min,去上清,缓缓加入75%乙醇1 mL洗涤,4 8000 r/min离心5 min,去上清,室温干燥RNA样品沉淀20 min,加入DEPC水10 L,使充分溶解。7.3RT-PCR反转录反应:5AMV Buffer 4 L、10 mmol/L dNTPs 2 L、下游引物 1 L、RNA 酶抑制剂 0.5L、RNA 模板 10L,AMV 反转录酶 0.5L,H2O(DEPC 处理)2 L,总体积为 20 L,瞬间离心混匀,65反应 15 min,42孵育 1 h,

7、95 5 min,同时设立阴性、阳性对照,产物于20保存备用。PCR 的反应:按 25 L 体系进行,含 MgCl2(25 mmol/L)1.5 L,灭菌水 15 L,反转录产物 4 L,10EXTaqDNA 聚合酶 buffer 2.5L,2 mmol/L dNTP 0.5 L,上、下游引物 50 pmol/L 各 0.5 L,EXTaqDNA 聚合酶 0.5 L。94 3 min,然后进入循环 94 30 s,52 30 s,72 30 s,30 个循环,于 72延伸 10 min,4保存。7.4结果观察将PCR反应产物于1.2%琼脂糖凝胶进行电泳,电压为120 V,时间30 min,紫外

8、灯下观察结果,并进行拍照。8结果判定在阳性对照出现相应扩增带、阴性对照无此扩增带是判定结果。检测样品出现与阳性对照相同目的条带大小为365bp的扩增片段是,判定为该样品为I型鸭肝炎核酸阳性;否则判定维阴性。如果阳性对照无相应的目的条带,可能是存在操作失误,该试验需要做重复试验;如果阴性对照有相应的目的条带,可能是阴性对照存在污染或是操作失误,该试验需要做重复试验。DB32/T 177520113附 录 A(规范性附录)阳性样品的制备用中和试验检测DHV阳性肝脏样品,阳性样品按如下方法制备:首先,无菌采集新鲜DHV阳性鸭肝脏,用无菌的剪刀剪碎并称量,然后以质量比15加入DEPC(diethypyrocarbonate 焦碳酸二乙酯)水,研磨成悬液,装入用DEPC处理过的离心管中,于20反复冻融3次,以12000 r/min,冷冻离心20 min,取上清接种11日龄鸭胚,0.1 mL/枚。置37 恒温箱继续培养,每天照蛋观察3次。弃去24 h前死亡胚,无菌收获24120 h死亡胚液,无菌分装,并进行病毒效价测定,病毒含量(EID50)达到10-3/0.1mL以上,即可作为阳性对照,20保存备用。

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