1、ICS 11.220 B 41 DB34 安徽省地方标准 DB 34/T 19402013 鸡传染性喉气管炎 PCR 检测技术规程 Technical regulation for detection of Chicken Infectious Laryngotracheitis by PCR 2013-08-28 发布 2013-09-28 实施安徽省质量技术监督局 发 布 DB34/T 19402013 I 前 言 本标准按照 GB/T 1.1-2009 给出的规则起草。本标准由安徽省农业委员会提出。本标准起草单位:安徽农业大学动物科技学院、安徽省动物疫病预防与控制中心。本标准主要起草人:
2、王桂军、朱良强、耿照玉、占松鹤、汪彤、江定丰、魏建忠、潘玲、陈静、何长生、杨德康、栗新、吴保谊。DB34/T 19402013 1 鸡传染性喉气管炎 PCR 检测技术规程 1 范围 本标准规定了应用聚合酶链反应(PCR)方法检测鸡传染性喉气管炎,包括样品的采集、样品处理、试验材料、操作程序和结果判定等。本标准适用于临床鸡传染性喉气管炎的检测和诊断。2 试验材料 2.1 特异性引物 根据 ILTV 的 TK 基因序列设计了一对引物,序列为:上游引物 A1:5-GGG AAA CTT GAA TGT CGG GAG-3,下游引物 A2:5-TGG ATT ATA CGC CGT GCC TGT-3
3、,扩增 DNA 片段大小为 329 bp,引物的使用浓度为 50 mmol/L。2.2 试剂 2.2.1 DNA 提取试剂 DNA 提取试剂如下:消化缓冲液:10 mmol/L Tris-Cl,pH 8.0;0.1 mmol/L EDTA,pH 8.0;10 SDS;20 mg/Ml 蛋白酶 K;苯酚;氯仿;无水乙醇;75乙醇;2.2.2 PCR 试剂 PCR 试剂如下:2Taq PCR MsaterMix 试剂;特异性引物;阳性对照:ILT 活疫苗(含鸡传染性喉气管炎 K317 株病毒)2.2.3 电泳试剂 电泳试剂如下:溴化乙锭;琼脂糖:电泳级;DB34/T 19402013 2 电泳缓冲
4、液 2.2.4 其他试剂 其他试剂如下:灭菌双蒸水;1 mol/L(灭菌)PBS:pH 7.2。2.3 仪器设备及耗材 2.3.1 仪器设备 本方法使用下列仪器设备:PCR 仪;电泳仪;电泳槽;紫外光透射仪;凝胶成像系统;小型高速离心机;水浴锅;旋涡振荡器;乳钵或玻璃研磨器;微量加样器:100 L1000 L、20 L200 L、5 L50 L 和 1 L10 L 等多种规格。2.3.2 一次性耗材 本方法使用下列一次性耗材:离心管(PP 材质):1.5 mL;PCR 反应管(PP 材质):0.2 mL;吸头:1 000 L、200 L、10 L 等多种规格。3 操作程序 3.1 喉头、气管组
5、织样品的处理 无菌采取发病鸡的喉头、器官组织样品,置于灭菌乳钵中剪碎,充分研磨,用灭菌 PBS 溶液配成 15 乳悬液,反复冻融 3 次。以 5 000r/min 离心 5 min,收集上清液,供 DNA 提取或置-20保存备用。3.2 待检样品 DNA 提取 3.2.1 喉头、气管组织样品 DNA 提取 取处理好的样品 250 L 于 1.5 mL 离心管中,每管加 400 L 消化缓冲液(500 mmol/L Tris,20 mmol/L EDTA,10 mmol/L NaCl,1 SDS),加蛋白酶 K 至终浓度 100 g/mL,混匀;50水浴 1 h。从水浴中取出消化后样品,每管加入
6、饱和苯酚 600 L,充分震荡摇匀,12000 r/min 离心 10 min;取上清液约 400 L,分别加入 200 L 饱和苯酚和 200 L 氯仿溶液,震荡摇匀,12000 r/min 离心 10 min;取上清液再加入 2.5 倍体积无水乙醇,摇匀后置-20沉淀 30 min;10000 r/min 离心 10 min,DB34/T 19402013 3 弃去上清液,加入 1 mL 75的酒精洗涤沉淀一次,将所得核酸沉淀物放在 42烘箱内烘干或室温放置自然晾干;每管中加入 30 L TE 或灭菌双蒸水。获得的DNA 样品可直接进行 PCR 反应或置-20保存备用。3.3 PCR 检测
7、 在冰浴条件下,按下列试剂用量在 PCR 反应管中分别加入各成分:2PCRTaqMix 酶 12.5 L 50 mmol/LILV 检测上下游引物(A1 和 A2):各 1 L,终浓度为 1 mmol/L;待检样品 DNA:5 L;灭菌双蒸水:补足至总体积为 25 L。加完试剂后瞬时离心混匀。将 PCR 反应管置于 PCR 仪内,按如下程序进行 PCR 反应:94预变性 3 min 后,进入循环 94变性 15 s,53退火 30 s,72延伸 30 s,30 个循环后,72延伸 10 min。PCR 产物可直接进行琼脂糖凝胶电泳分析或置 4保存备用。3.4 阳性及阴性对照 3.4.1 阳性对
8、照 用 ILT 活疫苗(含鸡传染性喉气管炎 K317 株病毒)作为阳性对照。3.4.2 阴性对照 用灭菌双蒸水作为阴性对照。3.5 电泳 3.5.1 制备 1.0琼脂糖凝胶板。3.5.2 取 5L PCR 产物,与 0.5L 加样缓冲液混合,加入琼脂糖凝胶板的加样孔中。3.5.3 加入分子量标准 DNA Marker。3.5.4 盖好电泳仪,插好电极,将电压调至 90V 左右电泳,3040min。3.5.5 取出凝胶,置于紫外凝胶成像仪系统扫描、拍照。3.5.6 以 DNA Marker 为参照分子量标准,判断 PCR 扩增片段大小。4 结果判定 将电泳后的琼脂糖凝胶置于紫外光透射仪上观察,与标准 DNA 分子量比较,分析结果,然后可用凝胶成像系统拍照保存。若待检样品在 329 bp 左右的位置出现一条特异性 DNA 条带,且与阳性对照的 DNA 条带位置一致,则判定为鸡传染性喉气管炎阳性。A _